主人公の少年ユウキ・コ()スモら地球()人が移民したソロ星で、第六文明人の遺跡が発掘された。遺跡の文献からフォルモッサ・()シェリルが導()き出した名()を取り、発掘された巨人ロボッ()トはイデオンと呼ばれるようになる()。
そのイデオンは、()異星人バッフ・ク()ランの伝説でイデの巨神として語り継がれていたものだった。イデ捜索隊隊長のギジェ・ザラルに無断で、カララ・アジバが調査()のためにソロ星()(ロゴ・ダウ)へ向かう。
コスモ、ジョーダン・()ベス、イ()ムホフ・カーシャがイデオンを操縦するが、二つの人類は双方とも相手を異星人と呼び、恐れ、自分の星を守るた()めに異星人を殲滅しようとして戦火を拡大させた()。
コスモ達はソロ星を捨て、イデオンの母船ソロシップに乗って宇宙()を逃亡する。