日暮戈薇是就读于国中三年级的15岁普通小女生,某日,她偶然通过家中神社的枯井来到了()500年前的战国时代。时狼烟四起(),妖怪横行,世间大地生灵涂炭。戈薇在御神木那里邂逅了被封印的半妖犬夜叉()。50年前,意欲变成真正妖怪的犬夜叉,为了得到四魂之()玉结识拥有强大灵力的()巫女桔梗。经过一段()时间相处,两人之间产生了感情。犬夜叉因此希望变成人类,而桔梗也打算在净化完四魂之玉后过回普()通人的生活。然而,对桔梗心存邪念的盗()贼鬼蜘蛛将灵魂和肉体献给妖怪,继而转生变成邪恶的半妖奈落。在他的一番挑拨下,犬夜叉被桔梗封印在神()木之上,重伤的桔梗也在悲伤绝望中死去。
桔梗转生()的戈薇解救了犬()夜叉,却不慎将四魂()之玉射成碎()片。为()了()找回碎片,她和犬夜()叉以及随后遇到的伙伴:七宝、弥勒、珊瑚踏上了充满艰难险阻的旅途……